Manon Sabourin s'intéresse notamment aux questions liées aux diverses méthodes contraceptives ainsi qu'aux facteurs influençant le choix d'un contraceptif et ceux influençant le choix en cas d'échec. Elle porte également un intérêt à la médicalisation grandissante de la santé reproductive des femmes. Aux cours des dernières années elle a développé une expertise relativement aux problèmes de fertilité ainsi qu'aux diverses technologies de procréation assistée. Elle s’intéresse tout particulièrement aux multiples enjeux psychosociaux et sexuels que présentent les problèmes de fertilité ainsi qu'aux enjeux éthiques que soulève le recours à ces technologies.

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